W XVI wieku Brandenburgia poparła reformację wbrew woli Wiednia i cesarza. Od XVII wieku elektorzy brandenburscy prowadzili politykę balansowania między Francją a Austrią, próbując zagarnąć dla siebie resztki po ich nabytkach. W czasie wojny o sukcesje hiszpańską (1702-1714) Królestwo Prus popierało Austrię, by potem stopniowo się od niej oddalać. Fryderyk Wielki (pan. 1740-1786) prowadził politykę skrajnie wrogą wobec Wiednia aż do późnych lat sześćdziesiątych XVIII wieku. Rewolucja Francuska zjednoczyła oba kraje wobec wspólnego zagrożenia. W czasie Wiosny Ludów oba kraje przeżywały podobne liberalne wstrząsy. Premier Prus Otto von Bismarck wybrał znów kurs wrogi Austrii.
Pruscy ambasadorzy i posłowie w Austrii 1688–1697 – Nikolaus Batholomäus von Danckelman 1699 – Otto Magnus von Dönhoff 1698–1703 – Christian Friedrich Bartholdi 1703–1714 – Friedrich Heinrich von Bartholdi 1714–1715 – Samuel von Cocceji 1732 – Gustav Adolf von Gotter 1741–1747 – Heinrich von Podewils 1771 – Jakob Friedrich Rhode 1792 – Christian von Haugwitz 1793–1797 – Girolamo Lucchesini 1823–1824 – August Heinrich Hermann von Dönhoff 1859 – Karl von Weyther
Zobacz też Ambasadorowie Austrii w Niemczech